Structure-function studies of the alpha pheromone receptor from yeast

Laura Marina Robles, César Millán-Pacheco, Nina Pastor, Gabriel Del Río

Resumen


Ste2p is a G protein-coupled receptor (GPCR) in Saccharomyces cerevisiae that mediates mating by responding to the alpha-mating factor pheromone. Ste2p belongs to a subfamily of GPCRs with no global sequence similarity to GPCRs of known atomic three-dimensional structure, yet it shares functional similarities with many of these. To deepen our understanding of the structure-function relationship of this receptor, we built an atomic three-dimensional homology-based model of Ste2p that was used to simulate the docking of the alpha pheromone. The Ste2p model is in general agreement with the available experimental data and allowed us to propose that the interface between Ste2p and alpha pheromone is formed by 26 residues, most of which are polar residues located at the three extracellular loops and helices HI, H5, and H6. This interface does not include Ile190, a highly conserved residue among fungal species, located at the second extracellular loop and therefore a potential binding site residue. By performing mutagenesis of STE2 at this position we observed only a small effect of this residue in receptor signaling. Hence, the Ste2p model presented here is consistent in general with current experimental data and constitutes a framework to test hypothesis about the structure-function relationship of this receptor.


Palabras clave


alpha pheromone receptor; docking; molecular modeling; pheromone; Ste2p

Texto completo:

PDF XML


DOI: https://doi.org/10.1016/j.recqb.2016.11.002

Enlaces refback

  • No hay ningún enlace refback.


Financiado por:

 

Proyecto C-297282

Licencia Creative Commons
TIP Revista Especializada en Ciencias Químico-Biológicas está distribuido bajo una Licencia Creative Commons Atribución-NoComercial-SinDerivar 4.0 Internacional.

TIP REVISTA ESPECIALIZADA EN CIENCIAS QUÍMICO-BIOLÓGICAS, Volumen 26, 2023, es una publicación editada por la Universidad Nacional Autónoma de México, Ciudad Universitaria, Deleg. Coyoacán, C.P. 04510, Ciudad de México, México, a través de la Facultad de Estudios Superiores Zaragoza, Campus I, Av. Guelatao # 66, Col. Ejército de Oriente, Deleg. Iztapalapa, C.P. 09230, Ciudad de México, México, Teléfono: 55.56.23.05.27, http://tip.zaragoza.unam.mx, Correo electrónico revistatip@yahoo.com, Editor responsable: Dra. Martha Asunción Sánchez Rodríguez, Certificado de Reserva de Derechos al Uso Exclusivo del Título No. 04-2014-062612263300-203, ISSN impreso: 1405-888X, ISSN electrónico: 2395-8723, otorgados por el Instituto Nacional del Derecho de Autor, Responsable de la última actualización de este número Claudia Ahumada Ballesteros, Facultad de Estudios Superiores Zaragoza, Av. Guelatao # 66, Col. Ejército de Oriente, Deleg. Iztapalapa, C.P. 09230, Ciudad de México, México, fecha de la última modificación, 27 de febrero de 2023.

Esta página puede ser reproducida con fines no lucrativos, siempre y cuando no se mutile, se cite la fuente completa y su dirección electrónica. De otra forma requiere permiso previo de la institución.